有极个别男性长有两个阴茎，这种双阴茎是怎样发生的呢？
人在胚胎期第6周时，其原始性腺都是一样的，后来两侧的生殖腺在中线合并成生殖结节，这个生殖结节可以在将来发育成阴茎，也可发育成阴蒂，如胎儿为男性，体内的Y染色体就使性腺演变成睾丸，睾丸分泌的男性激素就使生殖结节逐步演变成阴茎；如果在此时母亲因患病、服药或外界环境的影响，使胎儿生殖腺未能合并成一个生殖结节，那么胎儿就可以在两个生殖结节的基础上发育成两个阴茎。
双阴茎虽不多见，但形状多种多样，而且常同时有身体上的其他畸形。
一般可分两种类型：
一种是分支阴茎，即阴茎被纵形分隔为二，分隔可只发生在阴茎头部，而阴茎体是一个，因而呈“Y”型；也可以分隔在根部，而呈倒“Y”型。
另一种是完全分离的两个完整阴茎，但两个阴茎可以是完全分开的，也可以是相互依附在一起，有的左右并行，有的前后重复。两个阴茎可以各有尿道通向膀胱，因此两个可以同时排尿，也可以在不同时间分别排尿。有的则是一个有正常尿道的，而另一个是没有尿道的假阴茎。
双阴茎对人体健康一般并无危害，但是心理影响很大，患者常不愿去公开场合洗澡或游泳。治疗的方法须根据各人的情况而定，如有主有副而分离完全的，可以切除发育不好的阴茎而保留完好的；分支阴茎可将分隔开的两半阴茎互相缝合在一起；有些两个阴茎大小相等，且都有通向膀胱的尿道，手术就较困难，若勉强切除一个，外形也并不美观，只是功能上较为合理些，所以有时还得任其自然。